Pop!_OS 20.04는 앱 센터인 Pop!_Shop에서 Flatpak 앱 설치를 지원합니다. deb 패키지를 통해 설치된 시스템 라이브러리 버전에 상관없이 앱을 설치할 수 있기 때문에 상당히 편리하기는 하지만 그대신 사용자 디렉토리에 Flatpak 앱 실행에 필요한 라이브러리들을 별도로 설치하는데 앱마다 요구하는 라이브러리 버전이 다를 경우 같은 라이브러리의 여러 버전이 설치되기도 합니다.
이렇게 별도로 설치된 라이브러리들은 Flatpak을 통해 설치된 앱을 삭제해도 같이 삭제되지 않습니다. 대부분은 그냥 놔두어도 큰 문제는 없으나 지원이 종료되어 더이상 사용되지 않는 버전이 있는 라이브러리의 업데이트가 있을 경우 경고를 표시하면서 자동 업데이트가 되지 않는 문제가 있습니다. 매번 수동 업데이트를 하는 귀찮음을 피하기 위해서는 사용하지 않는 Flatpak 라이브러리 패키지들을 삭제해주어야 합니다. 명령어는 간단합니다.
flatpak uninstall --unused